В района на Янина се намира огромно наследство от религиозни паметници – византийски църкви, манастири и параклиси, които всяка година привличат вярващи от всички краища на Гърция, а също и от чужбина, тъй като районът през годините е бил кръстопът на религии и се гордее със своето безценно религиозно богатство.
В град Янина, и по-конкретно на остров Памвотида, има седем уникални манастира, построени между 13-и и 17-и век от видни семейства, преселили се в Епир след падането на Константинопол. Така районът се превръща в един от най-важните монашески центрове през този период. Първи е основан манастирът на Филантропините – ”Агиос Николаос”. От значимите стенописи на католикона особен интерес представлява стенописът на седемте мъдреци на Древна Гърция в южния екзонартекс.
Популярни дестинации са манастирите ”Дурахани” и ”Кастрица” в янинската падина, останали непроменени във времето.
Манастирът Цукас, посветен на Рождество Богородично, се намира на едноименния хълм, на 760 метра височина, в село Елинико – община Северна Дзумерка, и привлича хиляди вярващи всяка година. Според преданието манастирът е основан през 1190 година от император Исаак II Ангел, разрушен през 1736 година и реставриран през 1779 година.
Впечатляващ е манастирът ”Теотоку Кипинас” (”Богородица на Кипина”), построен почти в средата на огромна скала в североизточната част на спиращото дъха ждрело на река Каларитикос. Достъпът до манастира се осъществява по малка пътека, издълбана в скалата, и продължава с дървен мост, който води до стопанските постройки на манастира.
До едно от най-впечатляващите места в Гърция, ждрелото на река Аоос, се намира манастирът ”Панагия Стомиу”. Манастирът е получил името си от тясното ждрело, над което е построен. Манастирът ”Панагия Стомиу”, посветен на Пресвета Богородица, първоначално е построен на отсрещната страна през 1590 година, но се премества на сегашното си място през 1774 година, тъй като светата икона на манастира се пренася там по чудо. В манастира се съхраняват мощи на Свети Василий Велики, на Свети Йоан Златоуст, на Свети Алипий Стълпник и на други светци. От почти пълното му унищожаване от германската армия през 1943 година, оцелява само храмът. Реставратор на манастира е монахът Паисиос Агиоритис (Паисий Светогорски), родом от Коница, който е живял в манастира. Килията, която го приютява по време на четирите му години престой там, е запазена и до днес.
Близо до село Моливдоскепасто, в района на Коница, на границата с Албания и на 72 км от Янина, се намира ограден манастир, посветен на Успение Богородично, което се чества на 15 август. Името си дължи на факта, че в миналото покривът на манастира е бил покрит с оловни плочи. Вероятно е да е основан от византийския император Константин Погонат през 1521 година. Според преданието Погонат влиза високомерно в банята, разположена до древния храм, и излиза оттам черен, след което се разкайва за гордостта си и си възвръща здравето. По тази причина той построява църквата, покрита с оловни плочи. В църквата се намират изкусни дърворезби от 16-и век и стари иконописи.
Любителите на религиозния туризъм със сигурност ще се насладят на посещението в светия манастир ”Палюрис” в Зица, в светия манастир ”Евангелистрия Ано Пединон” в Загори, в манастира Сосинос в село Паракаламос, който наскоро бе реновиран, както и в манастира ”Панагия Мецову” (”Богородица на Мецово”). Това е затворен манастир, в който се открояват двуетажните килии, стаите за гости, павираните дворове на нива, дървената камбанария, стенописите от 1754 година и богато украсеният с дърворезба иконостас от 18-и век с икона на Богородица от 1728 година. В манастира се намира воденицата ”Гина”, наскоро реставрирана, образец на традиционното водно задвижване.